فرگشت خُرد، فرگشت در مقیاس کوچک است -در محدودهٔ یک جمعیت واحد. این به معنی محدود کردن توجهمان به یک شاخه از درخت حیات است.
اگر میتوانستید یکی از شاخههای درخت حیات را بزرگنمایی کنید -برای مثال، حشرات- یک فیلوژنی دیگر میدیدید که نسبهای همهٔ حشرات مختلف را به هم پیوند میدهد. اگر به بزرگنمایی ادامه دهید و شاخهٔ مربوط به سوسکها را انتخاب کنید، به یک فیلوژنی میرسید که گونههای مختلف سوسک را به هم پیوند میدهد. میتوانید آنقدر به بزرگنمایی ادامه دهید که به روابط بین جمعیتهای مختلف سوسکها برسید.

ولی چطور متوجه میشویم که به سطح جمعیتها رسیدهایم؟
تعریف جمعیت

امکانِ آمیزش در طبیعت مرزهای یک جمعیت را مشخص میکند.
تصویر از Northern Prairie Wildlife Research Center، USGS.
در حوزهٔ حیوانات، تصمیمگیری در مورد اینکه چه چیزی یک جمعیت است نسبتاً ساده است: گروهی از جانداران که با هم آمیزش دارند (به عبارتی، خزانهٔ ژنی آنها مشترک است). پس برای گونهٔ سوسکِ مورد بحث ما، جمعیت ممکن است گروهی از سوسکها باشد که همه روی قلهٔ کوهی خاص زندگی میکنند و جفتهای بالقوهای برای یکدیگر هستند.
زیستشناسانی که در این سطح دربارهٔ فرگشت پژوهش میکنند، فرگشت را به عنوان تغییر در فراوانی ژن در یک جمعیت تعریف میکنند.